http://hdl.handle.net/1834/3409 2013-05-21T23:48:57Z 2013-05-21T23:48:57Z Massó, J.A. http://hdl.handle.net/1834/3589 2011-09-13T00:01:46Z 2010-01-01T00:00:00Z

Title: Identificación y Expresión tejido específico de hepcidina y piscidina en la Guaseta del Pacífico Alphestes immaculatus (Breder, 1936). Authors: Massó, J.A. Abstract: Todos los organismos multicelulares son susceptibles a enfermedades, por lo que estos han desarrollado sistemas de defensa contra los organismos patógenos, y los peces no han sido la excepción. Su sistema inmune al igual que el resto de los vertebrados puede dividirse en dos tipos: el sistema inmune adaptativo y el sistema inmune innato. Ambos poseen componentes celulares y humorales. Dentro de los componentes humorales del sistema inmune innato se encuentran los péptidos antimicrobianos (AMPs), los cuales son típicamente de 12-50 aminoácidos con una carga neta positiva de +2 a +7. Debido a que los AMPs pueden desplegar una actividad de amplio espectro contra una gran variedad de patógenos y algunas células cancerosas, el interés de estos ha aumentado considerablemente por sus potenciales terapéuticos. Dentro de la variedad de AMPs conocidos se encuentran hepcidina y piscidina, los cuales han mostrado gran actividad antibacteriana. Hepcidina es un AMP ampliamente distribuido en vertebrados. En cambio piscidina es un AMP exclusivo de peces. Alphestes immaculatus es un serránido del cual existe escasa información, además, no existe ningún registro de la identificación de estos AMPs en esta especie ni en ningún serránido del Pacífico americano. Por esto, el propósito de este trabajo fue el identificar, evaluar la expresión basal y estimulada con LPS de hepcidina y piscidina, y además caracterizar la región del péptido maduro de hepcidina. Este trabajo identificó hepcidina y piscidina en A. immaculatus empleando oligonucleótidos degenerados. La mayor expresión basal de hepcidina fue en hígado, al igual que en la mayoría de los organismos, sin embargo, la expresión inducida por LPS mostró las mayores expresiones en intestino y riñón cefálico. Sabemos que el tejido intestinal suele estar expuesto a organismos patógenos, por otro lado, el riñón cefálico junto con el bazo son los principales tejidos linfoideos formadores de las células del sistema inmune. Para piscidina la mayor expresión basal se dio en riñón cefálico y bazo, los principales órganos linfoideos. En la expresión inducida con LPS, músculo y riñón cefálico fueron los tejidos con mayor expresión. Este es el primer reporte que evalúa músculo en una expresión inducida. El análisis de RACE 3´ nos permitió identificar 4 secuencias de ADNc diferentes, las cuales después de ser analizadas a detalle, pudimos observar que tres de estas poseen 8 cisteínas y una posee solo 7 cisteínas. Debido, a que existen varios reportes de duplicación de genes hepcidina, estas secuencias podrían provenir de cuatro diferentes genes de hepcidina. No obstante, esto solo podrá ser confirmado por la caracterización genómica completa y las regiones flanqueantes a estas.; All the multicellular organisms are susceptible to diseases, so the organisms have developed defense systems against the pathogens organisms, and fish had not the exception. The fish immune systems as the rest of the vertebrates can be divided in two types: the adaptive and innate immune system. Both posses cellular and humorals components. In the humoral components we can find the antimicrobial peptides (AMPs), which tipically are around 12-50 aminoacids with a positive net charge of +2 a +7. Because the AMPs can display a broad spectrum activity against great variety of pathogens and some cancer cells, the interest on the AMPs have seen increased considerably due to their therapeutic potencial. Within the broad variety of known AMPs are hepcidin and piscidina, which have shown great antibacterial activity. Hepcidin is an AMP broadly distributed in vertebrates. On the other hand, piscidin is an AMP exclusive in fish. Alphestes immaculatus is a serranid fish and the amount of information for this species is scarce. Besides, there is not any identification report of these AMPs in this specie and even in any serránido of the American Pacific. Then, the purpose of this work was to identify, evaluate both basal and LPS-stimulated expression of hepcidin and piscidina, and characterize the mature peptide region of hepcidin. This work identified hepcidin and piscidina in A. immaculatus using degenerated primers. The major basal expression of hepcidin was in liver as in the most of the organisms. Nevertheless, the LPS stimulated expression shown the major expressións in intestine and head kidney. It know that the intestinal tissue often is exposed to the pathogens organisms, on the other hand, the both head kidney and spleen are the main lymphoid tissues where the immune cells are created. The major basal expression for piscidina was in head kidney and spleen, the main lymphoid tissues. The LPS-stimulated expression, muscle and head kidney was the tissues with the major expression of piscidina. This is the first report that evaluate muscle in an induced expression. The RACE 3´ analysis identified 4 different cDNA sequences, which after been analyzed their shown that three of this sequences had 8 cysteines and one just 7 cysteines. Because several reports about hepcidin genes duplication exists, these sequences could come from four different hepcidin genes. However, this just can be comfirmed by the complete genomic characterization and their flanking regions.

2010-01-01T00:00:00Z Torres, G.M. http://hdl.handle.net/1834/3646 2011-09-13T00:10:01Z 2010-01-01T00:00:00Z

Title: Ecología de la Taxocenosis de Peracaridos Macrobentónicos en Playas arenosas protegidas: Análisis Multiescala de los patrones Ecológicos y Consideraciones para su manejo Sustentable. Authors: Torres, G.M. Abstract: Las playas arenosas son ambientes rigurosos donde los patrones comunitarios de macrofauna han sido relacionados con el tamaño de grano de arena, pendiente de la playa y procesos de ola/swash. Las relaciones entre la abundancia/diversidad de la macrofauna y morfodinámica de las playas micromareales de alta energía abiertas al mar dan pie a pensar un incremento de la abundancia/densidad desde playas con arena gruesa y fuerte pendiente hasta playas planas con arena fina y pendiente suave. Sin embargo, estas predicciones no han sido adecuadamente evaluadas cuando se trata de playas de baja energía protegidas, a pesar de que este tipo de playas es frecuente en la costa. En este trabajo se evalúan las características y variaciones de la taxocenosis de peracáridos los cuales representan a la comunidad biológica por considerarse el grupo representativo de este sistema. Las playas en las que se les estudió se localizan dentro de la Bahía de La Paz, Baja California Sur, México. Se hipotetizan diferencias entre playas y patrones ecológicos dependiendo del grado de exposición y se predice un incremento de la riqueza y abundancia en playas con la disminución de la exposición al oleaje. Para ello fueron determinados: el grado de exposición y variables físicas de las playas, conjuntamente con la taxocenosis de peracáridos y sus variaciones espaciales y temporales de la riqueza específica (S) y abundancia (A). Las playas seleccionadas variaron en su grado de exposición al oleaje y características del sedimento: Balandra tiene arena de carbonato y es protegida en una caleta dentro de la bahía; Conchalito posee arena mixta y es protegida detrás de una barrera natural de arena; y Mogote tiene arena mineral y es abierta al oleaje de la bahía. En verano de 2003, invierno de 2004 y verano – invierno de 2006, se llevaron a cabo, en cada ocasión, recolectas de núcleos de arena a lo largo de 2 líneas transversales a cada playa con unidades de muestreo (UM) en 7 niveles (A – G) ubicados desde la zona húmeda dejada por la pleamar hasta 3 m de profundidad en el mar. Cada UM se replicó dos veces, reuniendo así 21 UM en cada línea. Alternativamente se recolectaron 3 UM en los niveles B, F y G, para analizar las características granulométricas de la arena y el contenido de materia orgánica. En cada muestreo se determinó la pendiente y el ancho de la playa, la temperatura de la arena y del agua. Los patrones ecológicos y las diferencias espaciales y estacionales se determinaron mediante técnicas comunitarias multivariadas (ordenación y clasificación) así como mediante pruebas ANDEVA de dos vias, ANDEVA anidado y ANDESIM, dependiendo del caso. Fueron identificadas 59 taxa, incluyendo 16 nuevas especies para el Pacífico Mexicano y 18 citadas por primera vez en playas del Golfo de California. Las características ecológicas de estas playas fueron: a) el número de especies y la abundancia son mayores en playas con menor contenido de limo-arcilla y mayor permeabilidad y materia orgánica en la arena, sin variar este patrón en el tiempo; b) la riqueza específica y la abundancia de la taxocenosis incrementaron con la proximidad al mar en las tres playas; c) cinco especies de isópodos (Excirolana chamensis, E. mayana, E. braziliensis, Gnorimosphaeroma oregonense y Tylos punctatus), tres de anfípodos (Rhepoxynius heterocuspidatus, R. spp C, Corophium sp.) y dos de tanaidáceos (Pseudosphyrapus sp. y Biarticulata sp.) caracterizaron la taxocenosis de peracáridos; y d) las tres playas presentaron taxocenosis distintas. Los resultados sugieren la existencia de diferencias en el hábitat entre playas, dentro de las playas y en la taxocenosis de peracáridos correspondiente a cada playa. Estas diferencias se mantuvieron en el tiempo, tanto a nivel estacional como inter-anual. Los resultados obtenidos concuerdan con los estudios en otras playas del mismo tipo en Australia y difieren con lo observado en playas abiertas al océano. La riqueza de especies y abundancia de peracáridos se correlacionó negativamente con el ancho de la playa, tamaño de la arena y porcentaje de limo-arcilla; y positivamente con la permeabilidad y contenido de materia orgánica en los sedimentos. Los resultados respaldan la hipótesis de un incremento de la riqueza y abundancia de peracáridos en playas con menor exposición. Estos hallazgos muestran que las playas protegidas son vulnerables a la contaminación y a la erosión, dos aspectos a considerar para su uso estratégico, manejo, y potencial restauración. Se sugiere desarrollar una línea de investigación en ecología de playas arenosas de México, teniendo en cuenta la importancia socio-económica y ecológica de estos ecosistemas para el país.; Sandy beaches are rigorous environments where ecology patterns of communities have been related with grain size, slope and wave/swash processes. The relationship between abundance/diversity of macrofauna and morphodynamics on microtidal sandy beaches is predicted with an increment of beaches with coarse grain size and high slope to fine grain size and flat slope. However, these predictions have not been totally assessed on sheltered beaches in bays, and ecology assessment is uncommon on literature in spite of the fact these features are frequent on coasts. In this work the characteristics and variations of peracarid assemblages in three sheltered sandy beaches in Bahía de La Paz, Baja California Sur, Mexico are shown by supposing differences between places and ecology patterns depending on the degree of exposition of the beaches. An increment of richness and abundance is predicted on more sheltered sandy beaches. In this context we determined: the degree of exposition, peracarid assemblages present on each beach studied and spatial and temporal variations on species richness (S) and abundance (A) of peracarids (which are representing the full biology community from these beaches, because they are considered as the best representatives). The sandy beaches selected correspond to the three different kinds of grains found and to the degree of exposition to open sea. Balandra has carbonate sand and a sheltered in a small internal bay; Mogote has mineral sand and opened to the bay swell; and Conchalito has with mixed sand and sheltered behind a natural sandy barrier. In the summer of 2003, winter of 2004, and both seasons in 2006, a transect collecting cores in seven strata was made (from the drift line to three meters deep, A-G) on each beach. This transect was replicated twice, and another complete sample was made 150 meters away from of the first one. In this way on each sampling 21 sampling units (SU’s) were collected. Alternatively we collected nine cores on each sampling from B, F and G strata to determine granulometric and organic content. Each time slope beach, beach width and temperature of sand and water were measured. The ecology patterns and spatialseasonal variations were determined by multivariate tests (cluster and MDS) with transformed biotic variables (fourth root) and abiotic (log x + 1) variables. Homocedasticity, their variability and correlation were analyzed with ANOVA test. A total of 59 different species were collected, including 16 new reports on the Mexican Pacific coast and 18 new reports on the Gulf of California. The ecology characteristics were: a) species richness and abundance increased in sandy beaches with less silt-clay content and high permeability and organic matter content, without variation in the time; b) species richness and abundance of peracarid assemblage increased on the sea in the three beaches studied; c) five isopods (Excirolana chamensis, E. mayana, E. braziliensis, Gnorimosphaeroma oregonense and Tylos punctatus), three amphipods (Rhepoxynius heterocuspidatus, R. especies C, Corophium sp.), and two tanaids (Pseudosphyrapus sp. and Biarticulata sp.) determined peracarid assemblages; and d) the three beaches studied showed different assemblages. The results showed differences between beaches, within beaches and their peracarid assemblages. The differences were constant along time, inter annually, and seasonally. The results from this study agree with same beaches from west Australia and disagree with observations from exposed beaches, because wave/swash processes are modified in sheltered shores by their topography, sea level, and tidal range. Microtidal low-energy sandy shores, sheltered on bays, species richness and abundance of peracarids are negatively correlated with beach width, grain size, and percentage of siltclay; and positively with permeability and organic matter content. Community patterns did not vary along time, even in years or seasons. The results agree with the general prediction of the hypothesis of an increment in species richness and abundance on more sheltered beaches. Considerations about implications of these results in strategic use, management and potential restoration on sandy sheltered shores are discussed. Finally, coordination among researchers and implementation of more studies on sandy shores is suggested to develop management tools of this important resource of Mexico.

2010-01-01T00:00:00Z Lee, P. http://hdl.handle.net/1834/3645 2011-09-13T00:10:19Z 2010-01-01T00:00:00Z

Title: Estudios Comparativos para la Determinación de la Edad de Juvenilesde la Madreperla Pinctada Mazatlanica (HANLEY, 1856) Colectados en la Bahía de La Paz, B.C.S. Authors: Lee, P. Abstract: La ostra perlera Pinctada mazatlanica pertenece a la familia Pteriidae la cual tiene la habilidad de producir perlas. Sus perlas y nácar de alta calidad las ha convierte en un recurso natural de preferencia para su explotación. Desafortunadamente muchos aspectos de la determinación de la edad son pobre a pesar de ser un aspecto importante para su manejo pesquero. El desarrollo larvario puede durar de 23-25 días antes de fijación dependiente de la temperatura, salinidad, disponibilidad de alimento y substrato. Las marcas de crecimiento en la prodisoconcha y la disoconcha podrían representar el crecimiento diario de la larva y el juvenil, sin embargo su validación sustentaría la determinación de la edad que puede luego ser aplicado a modelos matemáticos. Este trabajo pretende determinar la edad de la larva y juvenil de madreperla como un dato importante que puede ser utilizado en trabajos futuros de deriva larvaria, ecológica y modelos pesqueros que permitan entender su dinámica poblacional. Se realizaron muestreos trimestrales desde marzo 2008 a mayo 2009 en 10 localidades en la Bahía de La Paz, B.C.S., Mexico. Todas las conchas de las madreperla capturada fue limpiada, medida, marcada con calceína fluorocromo, cortada dorso-ventralmente, teñidas con azul de Coomassie R-250 y examinada para la detección y conteo de marcas de crecimiento. Solo se capturaron juveniles durante los meses de julio-septiembre (n=158) y agosto-diciembre (n=143). La mayor abundancia de madreperla se colecto en San Gabriel, Isla Gallo, Mogote y Punta Mogote. El conteo de las marcas de crecimiento internas de la disoconcha teñidas con azul de Coomassie fue igual para las contadas en la aurícula ±2 lineas, se asumió que el crecimiento es diario. La validación de la periodicidad de las marcas no se logro mediante el marcado con calceína, sin embargo se logró por medio de su ciclo de desove.; The pearl oyster Pinctada mazatlanica is one species of the family Pteriidae which has the ability to naturally produce pearls. Its high quality pearls and nacar has made it one of the most preferable natural resource for exploitation. Unfortunately many aspects for age determination are poorly understood regardless of how important these aspects are for fisheries management. The larval development could take from 23-27 days before settlement; which may depend on water temperature, salinity, food availability and substrate. Growth rings for the prodissoconch and the dissoconch may represent each day of the larvae or adult`s life, the confirmation of the daily age mark will help determine the age of the organisms that can later be applied to different mathematical models. This work has been done with the sole purpose to determine larval and adult age for mother of pearl to use as core data in future larval drift, ecological and fishery model than can help understand population dynamics. Trimestral spat collection was done for a full year, from March 2008 to May 2009 at 10 different locations in La Paz Bay, S.B.C., Mexico. All P. mazatlanica shells collected where cleaned, measured, marked with calceine fluorocrome, cut along the shells height, dyed with Coomassie Blue R-250 and examined for growth marks on prodissoconch and dissoconch. Juveniles were only captured on the months of July- September (n=158) and August-December (n=143). Grater spat abundance was collected at San Gabriel, Gallo Island, Mogote and Mogote Point. The count for the growth rings of the internal cut of the dissoconch dyed with Coomassie Blue, was the same as the amount counted on the shell auricle ±2 lines, and where assumed as daily marks. Periodicity validation by calceine fluorocrome marking was unsuccessful; however this was achieved through the reproduction cycle.

2010-01-01T00:00:00Z Galíndez, D.K. http://hdl.handle.net/1834/3658 2011-09-13T00:10:35Z 2010-01-01T00:00:00Z

Title: Efecto del Flujo y el Seston sobre la Fisiología Energética del Callo de Hacha Atrina Maura (Sowerby 1835) y del Mejillón de Laguna Mytella Strigata (Hanley 1843) Authors: Galíndez, D.K. Abstract: Se examinó el efecto del flujo y seston sobre el callo de hacha Atrina maura y el mejillón de laguna Mytella strigata, bajo diferentes rangos de flujo y de exposición al flujo. En el primer experimento se usaron tres flujos (3.1, 7.3 y 12.1 cm/s) y en un tanque de circuito abierto durante 25 días, con agua proveniente de un estanque de cultivo de camarón y alta concentración de seston. Los mayores incrementos de las dimensiones de la concha, masas de tejidos e índice de condición de A. maura se obtuvieron a 7.3 y 12.1 cm/s, mientras que en M. strigata fueron a 3.1 cm/s. Los máximos contenidos de lípidos y acilgliceroles de A. maura en los tejidos se obtuvieron a los mayores flujos, mientras que en M. strigata, los máximos contenidos de lípidos y acilgliceroles están en relación inversa entre la glándula digestiva y el lóbulo gonadal por un posible mecanismo de transferencia de reservas asociadas a la madurez gonadal, mientras que las proteínas no presentaron diferencias significativas entre tejidos, y sólo los carbohidratos y glucógeno de la glándula digestiva fueron mayores a 12.1 cm/s. Estos resultados sugieren que el callo de hacha usó el flujo para incrementar su tamaño y de las reservas de los substratos energéticos, a los flujos mayores a 7.3 cm/s, mientras que el mejillón no fue afectado por el flujo. Ambas especies demostraron excelente capacidad para vivir en medios con alto contenido de seston, así mismo de aprovechar los nutrientes para su desarrollo y acumulación de reservas. Las diferencias entre especies se relacionaron con el estadio de desarrollo, de juvenil para A. maura con incrementos significativos de la concha y tejidos, y de adulto en el mejillón que alcanzó un buen índice de condición siendo aptos para el consumo. En el segundo experimento se evaluó de modo individual el efecto inmediato de flujos de 0.8, 1.6 y 2.5 cm/s y raciones entre 50 y 300 cel/μl de la microalga Isochrysis galbana, sobre el balance energético, los substratos energéticos y las respuestas inmunes en la glándula digestiva y el músculo aductor. A. maura presentó el mayor potencial de crecimiento a 1.6 cm/s, la eficiencia de absorción disminuyó con la tasa de ingestión, la tasa respiratoria incrementó con el flujo, las proteínas, carbohidratos y glucógeno positivamente se asociaron con la tasa de ingestión, y la tasa respiratoria con las respuestas inmunes. En M. strigata el máximo potencial de crecimiento se obtuvo a 1.6 cm/s siendo su desempeño afectado por la tasa respiratoria que incrementó linealmente con el flujo y fue inversamente proporcional a la concentración de microalgas. La eficiencia de absorción disminuyó por efecto del flujo e incrementó ligeramente con la concentración de microalgas. Los substratos energéticos tendieron a disminuir con el flujo y a incrementar con la concentración de microalgas. Los indicadores de respuestas inmunes tendieron a disminuir con el flujo y a incrementar con la concentración de microalgas, mientras que la peroxidación de lípidos fue proporcional con el flujo y en relación inversa con la concentración de microalgas. Las respuestas fisiológicas observadas a corto plazo de ambas especies indican que son sensibles a cambios leves en el flujo y de la concentración de microalgas, las cuales se deben considerar al momento de realizar experimentos y en la selección de localidades para su cultivo y como indicadores de su desempeño en el medio ambiente.; The effect of the water flow rates and concentrations of microalgae on growth of the penshell Atrina maura and the strigate mussel Mytella strigata was measured. In the first experiment, specimens were subjected to three experimental rates of flow (3.1, 7.3, and 12.1 cm/s) for 25 days. An open-circuit raceway with water drawn from a shrimp tidal pond was used. The penshell preferred flows of 7.3 and 12.1 cm/s, based on increase in shell length. The mussel preferred the lowest flow of 3.1 cm/s. Biochemical substrates were related to the flow treatments in both species. Protein, carbohydrate and glycogen decreased associated to the flow rate in the penshell. Higher lipid and acylglycerol content were associated with higher flow rates in the strigate mussel. Energy reserves in the penshell were transferred from the digestive gland carbohydrate to lipid and acylglicerol in the digestive gland and muscle. Energy reserves in mussels were transferred from the digestive gland to the gonad lobe, enhancing sexual maturity. The experiment demonstrated that both species grow well at high seston loads. Differences between species were associated with their different life cycles, juveniles in the penshell and adults in the mussel. In the second experiment, energy balance, biochemical substrates, and immune responses were tested at three flow rates (0.8, 1.6, and 2.5 cm/s) and several concentrations of the microalga Isochrysis galbana (50 to 300 cells/μL). Penshells preferred a flow rate of 1.6 cm/s, with maximum scope for growth (SFG) and ingestion rate in inverse relationship with absorption efficiency. Respiratory rate increased with the flow rate and decreased with concentration of the microalga; biochemical substrates were related to the ingestion rate and SFG; and the respiratory rate (R) was related to lipid peroxidation (TBARS). Penshell immune responses were clearly related to SFG and lysozyme content, GST, catalase, and AChE activity. Maximum SFG in the mussel was proportional to the ingestion rate and performance was affected by R, with R increasing with the flow and inversely proportional to the concentration of the microalga. Biochemical substrates were not clearly associated to the flow and microalga, however immune response biomarkers tended to decrease with increase of the respiratory rate and decreased with the concentration of the microalga. TBARS increased with the rate of flow and decreased with the concentration of the microalga. Short term physiological responses in both species showed that flow rate and food availability affects performance of the bivalves. The main results are valuable for eco-physiological research and advancing aquaculture practices as biomarkers or overall performance in the environment.

2010-01-01T00:00:00Z